Nội dung xoay quanh đặc vụ FBI Fox Mulder, do muốn tìm lại người em gái mất tích của mình, dấn thân vào điều tra X-files với niềm tin rằng em gái của anh bị người ngoài Trái Đất bắt cóc. Mulder rất tin tưởng vào sự tồn tại của người ngoài Trái Đất. Ban đầu, người cộng sự của anh, đặc vụ Dana Scully, không tin vào những điều Fox Mulder nói; nhưng với những bằng chứng cụ thể cùng với những vụ án thực tế cô và Mulder trải qua, dần dần Scully đã tin vào những hiện tượng kì bí ...